上海
編輯丨王多魚
排版丨水成文
環狀RNA（circRNA）是一種具有閉合環狀結構的 RNA 分子，與線性 RNA 形成鮮明對比。近期研究揭示了這些環狀轉錄本在基因調控和疾病發病機制中的新興作用.然而，它們的低表達水平以及與線性 RNA 高度相似的序列，給 circRNA 的檢測和表征帶來了巨大挑戰。
長讀長和單細胞 RNA 測序技術的最新進展，與基于深度學習的算法相結合，以前所未有的分辨率和規模徹底改變了對 circRNA 的研究。
2025 年 4 月 17 日，中國科學院動物研究所趙方慶團隊在Nature Genetics期刊受邀撰寫了題為：Circular RNA discovery with emerging sequencing and deep learning technologies的綜述論文。
該綜述系統總結了環狀RNA（circRNA）序列重構、定量解析及功能挖掘中的最新進展和核心挑戰，著重闡述了人工智能（AI）技術在 circRNA 研究中的關鍵作用，并進一步提出了 AI 驅動 circRNA 研究的理論框架和實踐路徑。
circRNA的鑒定、定量及差異表達分析
circRNA異構體結構的表征
circRNA的細胞異質性分析
circRNA的功能表征
大規模circRNA數據分析中的挑戰與機遇
總的來說，這篇綜述總結了 circRNA 的發現、表征和功能分析算法方面的最新突破，還探討了整合大規模 circRNA 測序數據所面臨的挑戰，并探索了人工智能（AI）驅動算法在未來的發展潛力，以充分挖掘 circRNA 研究在生物醫學應用中的全部潛力。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41588-025-02157-7
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