1960年8月，身為高級防空學校校長的王智濤，差點被轉業地方，葉帥把他要到軍科院工作。他離開空軍是被動的，可以說是被“趕走”的。

王智濤是軍事教育戰線的將領，在戰爭年代長期擔任軍事教育、訓練工作。從內心來說，更愿意干軍事工作，可并不得志。解放后，不愿再干軍事教育，而婉拒軍事學院訓練部副部長的職務。

在上海防空司令部擔任副司令，希望把剛起步的防空給琢磨透，成為合格的指揮員。

總是不湊巧，在上海防空司令部干得很順手時，因三反被審查而離開一線，到南昌擔任防空學校校長。

1957年，防空軍與空軍合并為新空軍，所在的院校隸屬于空軍，而他并不在在空軍工作，卻“逃不掉”。解放前，擔任航校教育長等，解放后為加強空軍司令部力量，調任訓練部參謀長，到任后成為閑置，要求離開，才去華東干防空工作，沒想到費勁周折要離開，卻兜兜轉轉7年后再次成為空軍干部。

1960年，他被“趕出”空軍，因1959年的反右傾時，被扣上帽子。

在軍委擴大會議召開后，照例由各大單位黨委召開會議傳達貫徹上級精神，空軍轉到高級防空學校對王智濤的“揭發”，都是與彭老總關聯的問題。因此，空軍首長指示，讓他寫一份書面材料，把事情交代清楚。材料交上去了，也就不了了之。

可在1960年8月，上級要免去他防空學校校長的職務，調去軍科院。原本讓他轉業地方，還是葉帥出面。能在這個契機下離開，對他來說喜憂參半。因為與軍事教育劃上句號，有點不舍；早想離開，如今如愿。

在軍科院工作時，擔任下轄二級部副部長，提拔為軍科院副秘書長。

1964年因身體不好開始長期休養，到各地去看。1965年，在上海看病時，得知劉亞樓也在這里，而且病情嚴重。作為過去的老部下，得知空軍首長身體有恙，怎么也應該過去看望一下，表示尊重和禮儀。

從個人情況來說，他對這位首長是有看法的，“三反”時就受到不公正待遇，后來被趕出空軍。當王智濤去看望時，劉亞樓睜開眼睛，說道：你怎么來了。他把自己因身體不適休養的情況說了一下，得知老首長生病就來看望。對方也說了一聲謝謝。因為情況不好，沒有聊太多，就離開了。

倆人早在抗戰初期抗大就認識，劉亞樓擔任訓練部長，他擔任軍教科長，曾經當著劉亞樓的面，給領導反映過對方的情況，也引起過誤會。解放后又遇到這樣那樣的事情。有人得知他倆矛盾深，他說如今都這樣，提那些陳芝麻爛谷子的事情沒有意義了，個人恩怨也就不存在了。