編者按
2003年4月14日,美、中、英、日、德、法等國聯(lián)合宣布,人類基因組序列圖提前繪制完成。至此,被譽(yù)為生命科學(xué)“登月計劃”的人類基因組計劃(Human Genome Project,HGP)告一段落。
楊煥明,基因組學(xué)家、中國科學(xué)院院士。他是作為中國代表首次參與國際HGP計劃的科學(xué)家之一,他經(jīng)歷、見證并參與了國際和國內(nèi)HGP從討論、實施到完成的全部過程。
如今,基因檢測技術(shù)已“走進(jìn)尋常百姓家”,而在二三十多年前,即便是科學(xué)家,對于基因檢測技術(shù)也很陌生。
轉(zhuǎn)變始于那一刻。
2003年4月14日,美、中、英、日、德、法等國聯(lián)合宣布,人類基因組序列圖提前繪制完成。該序列圖覆蓋了人類基因組所含基因區(qū)域的99%,精確率達(dá)到了99.99%。至此,歷時10多年,耗資27億美元,被譽(yù)為生命科學(xué)“登月計劃”的人類基因組計劃(Human Genome Project,HGP)終于以人類基因組序列圖提前繪制完成告一段落。中國作為唯一參與這項計劃的發(fā)展中國家,承擔(dān)了其中1%的任務(wù),完成了3號染色體上3000萬個堿基對的測序工作。
正是這看似不起眼的1%,促使中國成為了全球率先能夠獨(dú)立完成大型基因組分析的國家之一,帶動中國基因組學(xué)研究躋身世界前列。相關(guān)領(lǐng)域的發(fā)展也從追趕實現(xiàn)并跑,甚至部分細(xì)分領(lǐng)域的領(lǐng)跑。
“也許1%對整個項目而言有些微不足道,但它的實施給我國基因組學(xué)發(fā)展所帶來的意義卻是重大的。如果我們不加入,未來生物技術(shù)領(lǐng)域?qū)⒂肋h(yuǎn)仰人鼻息?!睍r隔多年,中國科學(xué)院院士、HGP中國項目發(fā)起人楊煥明如是闡釋當(dāng)初加入HGP的原因。
楊煥明
來源 | 中國科學(xué)院大學(xué)
“改寫中國生命科學(xué)地位的契機(jī)”
1990年,美國啟動人類基因組計劃,希望聯(lián)合英、日、法、德等國,用15年完成人體23對染色體30億個堿基對的測序任務(wù),繪制出4張圖:遺傳圖、物理圖、序列圖、轉(zhuǎn)錄圖。
“我們立刻意識到,這是改寫中國生命科學(xué)地位的契機(jī)。假如我們不做,錯過歷史機(jī)遇,我們就是罪人。”楊煥明說。
1997年11月,中國遺傳學(xué)組青年委員會第一次會議召開。在這次會上,楊煥明等人建議中國加入“人類基因組計劃”,并明確提出了一整套構(gòu)想。正是這套構(gòu)想,促成了日后中國科學(xué)院遺傳研究所人類基因組中心的誕生、運(yùn)轉(zhuǎn)和發(fā)展壯大。
1999年7月,國際人類基因組測序協(xié)作組登記。楊煥明等人以中國科學(xué)院遺傳研究所人類基因組中心的名義申請加入“國際測序俱樂部”。國際人類基因組組織批準(zhǔn)了中國專家的申請,并在網(wǎng)上公布了中國科學(xué)院遺傳研究所人類基因組中心的注冊。國際人類基因組計劃組織負(fù)責(zé)人將該中心稱為“BEIJING CENTER”——“北京中心”。
從此,“北京中心”頻繁出現(xiàn)在國際人類基因組組織的各個場合。
1999年9月1日,人類基因組第五次戰(zhàn)略討論會在倫敦召開。此時距人類基因組“工作草圖”的完成時間只有半年多,而這次會議就是最后確定各國科學(xué)家承擔(dān)的任務(wù),能否分到這塊“蛋糕”,成敗在此一舉。
作為人類基因組計劃國際組織中國聯(lián)系人,楊煥明不卑不亢、有張有弛的陳述,展示了“北京中心”的科研能力。國際同行一致認(rèn)為,中國科學(xué)院遺傳研究所人類基因組中心的設(shè)備運(yùn)行情況已達(dá)到國際先進(jìn)水平,中國科學(xué)家已掌握基因測序的技術(shù)關(guān)鍵和細(xì)節(jié)。
會議最后確定中國承擔(dān)1%的測序任務(wù),也就是3號染色體短臂上約3000萬個堿基對的測序。中國從而成為繼美、英、德、日、法之后第6個參與人類基因組計劃的國家,也是唯一的發(fā)展中國家。
得到國外同行認(rèn)可
按計劃,人類基因組“工作草圖”在2000年春末完成。只有不到一年的時間,中國人能否和國際同行同步登上這座高峰?這是一個極為嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。
1999年9月9日9時,北京順義空港工業(yè)區(qū),一個簡單的中國“1%項目”動員大會準(zhǔn)時舉行。為了搶時間,大規(guī)模的基因測序于1999年10月1日正式開始??蒲腥藛T利用14臺測序儀對基因材料——堿基進(jìn)行測序。
與此同時,科技部、中國科學(xué)院和國家高技術(shù)計劃生物領(lǐng)域?qū)<椅瘑T會經(jīng)過論證決定給予最大支持。1%任務(wù)被分解到國家人類基因組南方中心和北方中心,科學(xué)家聯(lián)起手來,開始了向人類基因組計劃的最后沖刺!
沒有節(jié)假日和周末,所有人都傾盡全力,以按期完成任務(wù)。測序過程中,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)3號染色體短臂的DNA片段富含重復(fù)序列,常規(guī)“鳥槍法”測序誤差率高達(dá)15%。團(tuán)隊創(chuàng)新性地采用“克隆池分級篩選法”——將DNA切割成15萬個片段,通過大腸桿菌克隆擴(kuò)增后逐級比對?!斑@就像把一本撕碎的書拼回原樣,但每頁都有大量重復(fù)字句?!痹璈GP中國項目核心成員汪建回憶說。
2000年5月,美國冷泉港,人類基因組再次舉行戰(zhàn)略會議,參與公共人類基因組計劃的6國科學(xué)家聚集一堂。此時各個研究中心所承擔(dān)的測序任務(wù)都已接近尾聲或已做完。
當(dāng)楊煥明匯報中國承擔(dān)的任務(wù)全部完成時,熱烈的掌聲隨即在全場響起?!癢onderful!Wonderful!Wonderful!”美國人類基因組計劃負(fù)責(zé)人向楊煥明祝賀。3個“Wonderful”,表達(dá)出對中國科學(xué)家的贊揚(yáng)和敬意。
真正理解了開放合作的分量
2001年2月15日,《自然》(Nature)雜志發(fā)表由美、英、日、德、法、中六國科學(xué)家共同完成的人類基因組序列草圖。這篇長達(dá)62頁的封面文章,不僅是人類基因組計劃的一個重要里程碑,也開創(chuàng)了一種史無前例的國際協(xié)作新篇章。
Nature雜志2001年2月15日封面
來源 | 《自然》雜志網(wǎng)站
對于我國而言,更深遠(yuǎn)的意義在于,中國從此獲得HGP數(shù)據(jù)完全共享權(quán),并參與制定國際基因數(shù)據(jù)使用規(guī)范。
“過去我們只能購買二手?jǐn)?shù)據(jù)庫,現(xiàn)在可以直接參與規(guī)則制定?!闭憬髮W(xué)醫(yī)學(xué)院教授祁鳴舉例,中國團(tuán)隊基于HGP數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)的3號染色體短臂上的LCN2基因,現(xiàn)已被證實與肝癌轉(zhuǎn)移密切相關(guān),相關(guān)專利授權(quán)至美、歐多家藥企。
這場“科學(xué)入世”更重塑了中國的科研生態(tài)。繼完成人類基因組計劃的1%任務(wù)后,國內(nèi)科學(xué)家還承擔(dān)了“國際人類基因組單體型圖計劃”的10%任務(wù)、第一個“亞洲人基因組圖譜”(“炎黃一號”)的100%任務(wù),同時,主導(dǎo)及參與了地球生物基因組計劃(EBP)、國際千人基因組計劃、人體腸道微生物基因組研究計劃(MetaHIT)等大型國際科研項目,完成了水稻、家蠶、家雞等物種的基因圖譜繪制……多項具有國際影響力的研究成果,奠定了中國在生命科學(xué)領(lǐng)域中的領(lǐng)先地位。
但在HGP親歷者眼中,最珍貴的遺產(chǎn)是科研理念的轉(zhuǎn)變?!斑^去我們習(xí)慣‘單打獨(dú)斗’,這1%讓中國科學(xué)界真正理解了開放合作的分量?!睏顭髡f。
20多年來,人類基因組計劃對生命科學(xué)發(fā)展和人類社會都產(chǎn)生了巨大的積極影響。
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中國科學(xué)家博物館出品
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