來(lái)源:丁香科研
當(dāng)你以為公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)都是外國(guó)創(chuàng)建時(shí),這些國(guó)家級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)帶你領(lǐng)略不一樣的科研中國(guó)、數(shù)據(jù)中國(guó)。
了解中國(guó)醫(yī)療現(xiàn)狀,其實(shí)我們還能從以下這些數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取信息,接下來(lái)筆者就給大家分享幾個(gè)國(guó)內(nèi)的數(shù)據(jù)庫(kù)。
NO.1 國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心
(網(wǎng)址:https://ngdc.cncb.ac.cn/?lang = zh)
國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(National Genomics Data Center,簡(jiǎn)稱 NGDC)已發(fā)布了15 大數(shù)據(jù)資源體系、40 個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。
涵蓋生物項(xiàng)目數(shù)據(jù)、生物樣本數(shù)據(jù)、組學(xué)原始數(shù)據(jù)、基因組序列、基因組變異數(shù)據(jù)、生物信息工具等,形成了重要的國(guó)際影響力。
2020 年,NGDC 開(kāi)發(fā)了 8 個(gè)全新數(shù)據(jù)庫(kù)(2019nCoVR,Aging Atlas,BrainBase,CGIR,GTDB,LncExpDB,scMethBank 和 TransCirc)。
更新和豐富了多個(gè)核心數(shù)據(jù)庫(kù)資源(BioProject,BioSample,GSA,GWH,GVM,GEN 和生物多樣性資源等)。
涉及疾病、衰老、調(diào)控和生物多樣性等多個(gè)前沿領(lǐng)域,初步形成我國(guó)生物數(shù)據(jù)安全匯交管理和多組學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)的國(guó)家中心數(shù)據(jù)資源體系。
其中,「2019 新型冠狀病毒信息庫(kù)」是目前全球收錄信息最全和訪問(wèn)最多的新冠病毒序列信息庫(kù)之一,它始終保持全球最新、最完整的新冠病毒基因組數(shù)據(jù)發(fā)布動(dòng)態(tài)。
GVM(Genome Variation Map)是國(guó)內(nèi)規(guī)模最大的多物種基因組序列變異庫(kù)。
NGDC 免費(fèi)向國(guó)內(nèi)外用戶提供方便快捷的多組學(xué)數(shù)據(jù)匯交和存儲(chǔ)服務(wù)。
截至 2020 年 12 月,已匯交來(lái)自 343 個(gè)單位 1206 個(gè)用戶遞交的超過(guò) 6PB 的組學(xué)數(shù)據(jù),相關(guān)數(shù)據(jù)發(fā)表于 203 種國(guó)內(nèi)外期刊的 466 篇文章。
圖片來(lái)源:國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
NO.2 國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心
(網(wǎng)址:https://nmdc.cn/)
國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心(National Microbiology Data Center ,NMDC)數(shù)據(jù)記錄數(shù)超過(guò) 40 億條。
數(shù)據(jù)內(nèi)容完整覆蓋微生物資源、微生物及交叉技術(shù)方法、研究過(guò)程及工程、微生物組學(xué)、微生物技術(shù)以及微生物文獻(xiàn)、專利、專家、成果等微生物研究的全生命周期,承擔(dān)微生物領(lǐng)域科學(xué)數(shù)據(jù)匯交管理、共享與服務(wù)工作。
NMDC 具有以下特點(diǎn):
①國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心發(fā)布的數(shù)據(jù)編號(hào),可在國(guó)際期刊直接使用。
②支撐中國(guó)科學(xué)家發(fā)表文章時(shí)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、共享。
③支持微生物樣本、核酸序列、微生物基因組、微生物元基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、期刊附件等多種類型數(shù)據(jù)提交。
④支持國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、科技資源調(diào)查專項(xiàng)、國(guó)際合作專項(xiàng)等項(xiàng)目數(shù)據(jù)匯交。
⑤數(shù)據(jù)當(dāng)日提交三個(gè)工作日內(nèi)完成審核并發(fā)放編號(hào)。
⑥為每條數(shù)據(jù)提供唯一標(biāo)識(shí)符。
圖片來(lái)源:國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
NO.3 國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心
(網(wǎng)址:https://www.ncmi.cn/)
國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心(National Population Health Data Center, NPHDC),構(gòu)建包含數(shù)據(jù)注冊(cè)服務(wù)、匯交服務(wù)、長(zhǎng)期保存服務(wù)、定制化服務(wù)、數(shù)據(jù)接口服務(wù)、專題服務(wù)、科普服務(wù)、應(yīng)用示范等多維度的國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)服務(wù)體系。
建庫(kù)至今,NPHDC 已收錄 1179 個(gè)項(xiàng)目、1.4 萬(wàn)多個(gè)數(shù)據(jù)集,推出「青少年健康主題數(shù)據(jù)庫(kù)」、「全人類心理健康科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)」、「中國(guó)圍產(chǎn)期母嬰健康監(jiān)護(hù)與 AI 風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)」、「中國(guó)流動(dòng)人口衛(wèi)生計(jì)生動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)健康數(shù)據(jù) (2009-2017 年)」、「典型地區(qū)行為活動(dòng)模式數(shù)據(jù)庫(kù)」、「前列腺腫瘤預(yù)警數(shù)據(jù)集」、「糖尿病并發(fā)癥預(yù)警數(shù)據(jù)集」、「2001-2020 年中國(guó)衛(wèi)生健康事業(yè)發(fā)展統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)」8 大特色資源。
提供「中國(guó)人成骨不全癥變異數(shù)據(jù)庫(kù)」、「老年醫(yī)學(xué)專題服務(wù)」、「氣象環(huán)境與健康專題服務(wù)」、「國(guó)民體質(zhì)與健康數(shù)據(jù)庫(kù)」、「熱點(diǎn)傳染病預(yù)警與追蹤」、「衛(wèi)生決策專題服務(wù)」、「腦卒中防治工程管理專項(xiàng)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)」等 13 個(gè)主題數(shù)據(jù)服務(wù),并配套 Tableau、R 等多個(gè)數(shù)據(jù)配套工具服務(wù)。
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
NO.4 國(guó)家基礎(chǔ)學(xué)科公共科學(xué)數(shù)據(jù)中心
(網(wǎng)址:https://www.nbsdc.cn/)
國(guó)家基礎(chǔ)學(xué)科公共科學(xué)數(shù)據(jù)中心(National Basic Science Data Center, NBSDC)數(shù)據(jù)資源覆蓋 17 類一級(jí)學(xué)科、八大基礎(chǔ)學(xué)科、三大區(qū)域和部分基礎(chǔ)前沿領(lǐng)域。
以領(lǐng)域科學(xué)數(shù)據(jù)家實(shí)驗(yàn)室自主采集或野外觀測(cè)為主,以及基于自產(chǎn)數(shù)據(jù)和公開(kāi)數(shù)據(jù)融合加工的增值產(chǎn)品,已經(jīng)系統(tǒng)整合形成了 23 個(gè)主題庫(kù)和專題庫(kù)。
在線服務(wù)數(shù)據(jù)總量 2.29 PB,數(shù)據(jù)記錄近 10 億條,形成完善的標(biāo)準(zhǔn)體系、技術(shù)體系和軟件棧,服務(wù)體系全面覆蓋「數(shù)據(jù)服務(wù)-信息服務(wù)-知識(shí)服務(wù)」。
除數(shù)據(jù)庫(kù)在線查詢服務(wù)外,平臺(tái)也針對(duì)用戶對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行加工、處理、計(jì)算、分析等需求,提供了基于科學(xué)數(shù)據(jù)的在線分析平臺(tái)、特種數(shù)據(jù)離線數(shù)據(jù)處理工具,提供深度服務(wù)。
圖片來(lái)源:國(guó)家基礎(chǔ)學(xué)科公共科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
說(shuō)了這么多,家人們迫不及待想知道怎么獲取這些數(shù)據(jù)了吧!每個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)獲取的方式大同小異,均以「在線提交數(shù)據(jù)申請(qǐng)」方式以獲得官方審批并發(fā)送數(shù)據(jù)下載鏈接。
接下來(lái)筆者以「國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心」為例,來(lái)為大家提供 get 免費(fèi)數(shù)據(jù)的方式……
Step 1:數(shù)據(jù)庫(kù)提供三種在線網(wǎng)絡(luò)提交申請(qǐng)和注冊(cè)的方式,分別是:個(gè)人賬號(hào)注冊(cè)、機(jī)構(gòu)賬號(hào)注冊(cè)、合作機(jī)構(gòu)賬號(hào)注冊(cè)。
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
Step 2:根據(jù)實(shí)際情況,任選一種注冊(cè)途徑。個(gè)人賬號(hào)提供郵箱和手機(jī)注冊(cè)方式,普通用戶可在系統(tǒng)上瀏覽、查詢和下載數(shù)據(jù),以及進(jìn)行個(gè)人數(shù)據(jù)匯交。
機(jī)構(gòu)賬號(hào)面向機(jī)構(gòu)用戶進(jìn)行數(shù)據(jù)注冊(cè)、匯交、管理和機(jī)構(gòu)標(biāo)識(shí)符申請(qǐng),掛靠機(jī)構(gòu)的注冊(cè)用戶可在系統(tǒng)上進(jìn)行機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)匯交和項(xiàng)目數(shù)據(jù)匯交。
合作機(jī)構(gòu)賬號(hào)支持?jǐn)?shù)據(jù)加工員賬號(hào)和數(shù)據(jù)審核員賬號(hào)的創(chuàng)建、編輯和管理,以及支持合作機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)匯交、審核和管理等功能,但僅限與國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心建立合作關(guān)系的機(jī)構(gòu)申請(qǐng)。
個(gè)人賬號(hào)—郵箱注冊(cè)
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
個(gè)人賬號(hào)—手機(jī)注冊(cè)
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
機(jī)構(gòu)賬號(hào)
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
合作機(jī)構(gòu)賬號(hào)
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
Step 3:注冊(cè)成功后登錄賬號(hào)
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
Step 4:以選擇「特色資源」中「中國(guó)圍產(chǎn)期母嬰健康監(jiān)護(hù)與 AI 風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警主題科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)」為例,可在數(shù)據(jù)庫(kù)詳情頁(yè)中了解基本信息、描述信息、創(chuàng)建者信息、聯(lián)系信息、引用格式、服務(wù)信息、數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)信息等。
其中,服務(wù)信息中,會(huì)明確說(shuō)明數(shù)據(jù)公開(kāi)時(shí)間、實(shí)體數(shù)據(jù)共享方式、數(shù)據(jù)使用許可、收費(fèi)方式、申請(qǐng)流程等。
類似地,「中國(guó)圍產(chǎn)期母嬰健康監(jiān)護(hù)與 AI 風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警主題科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)」屬于公開(kāi),公益免費(fèi)、商業(yè)收費(fèi)數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)以 xlsx、png 形式儲(chǔ)存,詳情頁(yè)底部即是實(shí)體數(shù)據(jù)申請(qǐng)?jiān)L問(wèn)入口,并提供數(shù)據(jù)引用參考規(guī)范及致謝方式。
圖片來(lái)源:國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心官網(wǎng)
四款國(guó)家科學(xué)數(shù)據(jù)中心,有你感興趣的嗎?如果是你的科研領(lǐng)域,戳戳手指去了解一波吧。
我們長(zhǎng)期為科研用戶提供前沿資訊、實(shí)驗(yàn)方法、選品推薦等服務(wù),并且組建了 70 多個(gè)不同領(lǐng)域的專業(yè)交流群,覆蓋PCR、細(xì)胞實(shí)驗(yàn)、蛋白研究、神經(jīng)科學(xué)、腫瘤免疫、基因編輯、外泌體、類器官等領(lǐng)域,定期分享實(shí)驗(yàn)干貨、文獻(xiàn)解讀等活動(dòng)。
添加實(shí)驗(yàn)菌企微,回復(fù)【】中的序號(hào),即可領(lǐng)取對(duì)應(yīng)的資料包哦~
【2401】論文寫作干貨資料(100 頁(yè))
【2402】國(guó)內(nèi)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法匯總(60 頁(yè))
【2403】2024 最新最全影響因子(20000+ 期刊目錄)
【2404】免疫學(xué)信號(hào)通路手冊(cè)
【2405】PCR 實(shí)驗(yàn) protocol 匯總
【2406】免疫熒光實(shí)驗(yàn) protocol 合集
【2407】細(xì)胞培養(yǎng)手冊(cè)
【2408】蛋白純化實(shí)驗(yàn)手冊(cè)
【2501】染色體分析方法匯總
【2502】國(guó)自然中標(biāo)標(biāo)書模板
【2503】WB 實(shí)驗(yàn)詳解及常見(jiàn)問(wèn)題解答
【2504】DeepSeek 論文寫作常用口令
【2505】中國(guó)科學(xué)院期刊分區(qū)表(2025 年最新版)
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