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本文來源:iNature等
受乳腺癌易感蛋白(BRCA1)突變影響的癌細(xì)胞通常會遭受更多的DNA損傷和基因組不穩(wěn)定。BRCA1的物理變化影響其在DNA維持中的作用的確切方式尚不清楚。
2017年9月20日,弗吉尼亞理工大學(xué)Deborah F. Kelly團(tuán)隊(duì)在Science Advances 在線發(fā)表題為“Structural analysis of BRCA1 reveals modification hotspot”的研究論文,該研究使用單粒子電子顯微鏡研究了乳腺癌細(xì)胞中自然產(chǎn)生的BRCA1的三維特性。
結(jié)構(gòu)研究揭示了全長BRCA1的新信息,涉及其核結(jié)合伙伴BRCA1相關(guān)環(huán)結(jié)構(gòu)域蛋白(BARD1)。同樣重要的是,在突變的BRCA1中發(fā)現(xiàn)了一個對泛素化高度敏感的區(qū)域。研究人員把這個站點(diǎn)稱為一個修改版的“熱點(diǎn)”。熱點(diǎn)區(qū)域的泛素加合物被證明是生物化學(xué)可逆的??偟膩碚f,該研究展示了BRCA1的關(guān)鍵變化如何影響其結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,并為潛在地調(diào)節(jié)人類癌細(xì)胞中突變的BRCA1提供了新的見解。
2024年9月11日,該文章被撤回,主要原因是數(shù)據(jù)篡改。
另外,2024年8月22日,Nanoscale 撤回了弗吉尼亞理工大學(xué)Deborah F. Kelly團(tuán)隊(duì)于2021年4月21日發(fā)表題為“Microchip-based structure determination of low-molecular weight proteins using cryo-electron microscopy”的研究論文,主要原因是文章存在大量的數(shù)據(jù)異常。
截止到2025年4月2日,Deborah F. Kelly已經(jīng)被Science Advances ,Nanoscale 及ADVANCED MATERIALS 等撤回了8篇文章(文章后附列表)。最后,據(jù)了解,Deborah F. Kelly團(tuán)隊(duì)的21篇文章被質(zhì)疑數(shù)據(jù)異常,主要有4個原因:
● 對不同條件和樣品的圖形和圖像的重復(fù)使用;
● 電子顯微鏡下的圖像沒有預(yù)期的像素大??;
● 與電子顯微鏡圖不相關(guān)的原子模型;
● 電子顯微鏡圖在其規(guī)定的分辨率下沒有預(yù)期的特征。
發(fā)表后,有讀者擔(dān)心冷凍電鏡圖譜被篡改。作為一個特殊的例子,EMDB-8834的圖譜似乎是使用體積擦除工具在圖譜上創(chuàng)建一個球形孔而改變的。這些問題已提交給作者,并于2024年3月13日在論文上發(fā)表了編輯關(guān)注表達(dá)。
多位Cryo-EM專家對作者的回復(fù)進(jìn)行了審查,并得出結(jié)論,認(rèn)為本文中數(shù)據(jù)的完整性仍存在未解決的問題。
因此,Science Advances 的編輯們決定撤回這篇論文。一些但不是所有的作者都同意這次撤稿,還有一些人沒有回應(yīng)。Deborah F. Kelly不同意撤稿。
Deborah F. Kelly的撤稿文章列表:
[1]Structural analysis of BRCA1 reveals modification hotspot,Sci Adv ;
[2]Microchip-based structure determination of low-molecular weight proteins using cryo-electron microscopy,Nanoscale ;
[3]High-Resolution Imaging of Human Viruses in Liquid Droplets,Adv Mater ;
[4]Automated Tools to Advance High-Resolution Imaging in Liquid,Microsc Microanal ;
[5]High-Resolution Imaging of Human Cancer Proteins Using Microprocessor Materials,Chembiochem ;
[6]Liquid-EM goes viral - visualizing structure and dynamics,Curr Opin Struct Biol ;
[7]Structural Insights of the SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein: Implications for the Inner-workings of Rapid Antigen Tests,Microsc Microanal ;
[8]Cryo-EM reveals architectural diversity in active rotavirus particles,Comput Struct Biotechnol J ;
參考消息:
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.1701386
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/nr/d4nr90151g
https://retractionwatch.com/2024/09/11/penn-state-prof-earns-second-retraction-faces-third-following-university-probe/
https://pubpeer.com/search?q=Deborah+F.+Kelly
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