青蒿素是世界衛生組織推薦的主要抗瘧藥物,其獨特的過氧橋結構使其能夠快速清除瘧原蟲,對抗藥性瘧疾也表現出顯著療效。自中國科學家屠呦呦發現青蒿素以來,這一藥物已挽救了數百萬人的生命,尤其在非洲等瘧疾高發地區。但它的供應長期依賴植物提取(黃花蒿),面臨產量波動和價格高昂的挑戰。雖然通過微生物發酵生產青蒿素前體(如青蒿酸 AA)已取得突破,但現有工藝仍需多步化學轉化,效率低且依賴貴金屬催化劑。
近日,賓夕法尼亞大學研究團隊在 ACS Synthetic Biology 發表的最新研究“Combining Chemical Catalysis with Enzymatic Steps for the Synthesis of the Artemisinin Precursor Dihydroartemisinic Acid”中,另辟蹊徑:他們繞開傳統中間體 AA,直接合成更接近終產物的二氫青蒿酸(DHAA),并通過 AI 工具與化學—酶法協同,開創了一條更短、更高效的合成路徑。
研究團隊首先利用自主開發的從頭生物合成路徑設計工具 novoStoic,輸入起始分子 AMPD(紫穗槐二烯)與目標產物 DHAA 的化學式,要求AI探索碳平衡且能量可行的合成路徑。novoStoic 通過分析已知反應規則,提出了一條包含兩個全新步驟的路線:第一步將 AMPD 轉化為二氫青蒿醇(DHAL),第二步通過氧化反應生成二氫青蒿醛(DHALD),最終由已知酶催化生成 DHAA。然而,AI 設計的“完美路線”在現實中卻遭遇瓶頸——第一步反應熱力學計算顯示熱力學不可行,這意味著反應無法自發進行。
圖 | 圖中虛線箭頭表示通過 novoStoic 工具設計的兩步全新反應
面對酶法失效的困境,團隊轉向化學催化。他們借鑒已有研究,采用 9-硼雙環[3.3.1]壬烷(9-BBN)催化 AMPD 的反馬氏規則加成反應,成功以 70% 的產率獲得 DHAL。這一步驟的關鍵在于精準控制羥基的加成位置,避免傳統催化劑對雙鍵位置的選擇性干擾。化學催化的引入不僅解決了熱力學障礙,還大幅縮短了反應步驟——傳統工藝需先將 AMPD 轉化為 AA,再經氫化得到 DHAA,而新路徑直接跳過了 AA 階段。
第二步從 DHAL 到 DHALD 的氧化反應仍需高效的生物催化劑。團隊從文獻中篩選了十種已知的醇脫氫酶(ADH),在大腸桿菌中表達并純化后逐一測試。隨后,鏈霉菌來源的 ScCR-ADH被確定為催化 DHAL 氧化為二氫青蒿醛(DHALD)的最優酶,其活性經 GC-MS 驗證。最終,研究團隊利用已知的醛脫氫酶 ALDH1,將 DHALD 高效催化轉化為 DHAA,該步驟的可行性已通過文獻支持與實驗數據雙重驗證,標志著從 AMPD 到 DHAA 的全合成路徑成功貫通。
圖 | 對從 DHALD 到 DHAA 的轉化進行 GC-MS 分析
相較于現有的需五步反應的工藝,包括 AA 合成與氫化步驟,新路徑通過化學—酶法協同策略將總步驟縮減至三步,效率提升 40%。盡管整體產率尚未公開,但單步的高效性已凸顯其技術優勢。此外,連續反應體系的“一鍋法”操作避免了中間體分離需求,大幅降低溶劑消耗與操作復雜性,為工業化生產提供了兼具經濟性與可持續性的新范式。
傳統 DHAA 合成依賴貴金屬催化劑(如威爾金森催化劑)和復雜的光氧化步驟,而新路徑采用廉價硼試劑與常溫酶反應,大幅降低能耗與廢棄物。此外,路徑縮短意味著原料與溶劑的消耗減少。團隊進一步提出,未來可用光催化替代硼試劑,進一步提升可持續性。這項研究不僅是化學-酶法協同的典范,更揭示了 AI 工具在合成生物學中的革命性潛力。novoStoic 通過熱力學分析與反應規則推演,快速鎖定可行路徑;而人類研究者則憑借經驗判斷,將AI的“理論方案”轉化為實際可操作的步驟。這種“人機協作”模式或將加速更多藥物的高效合成,為應對全球健康挑戰提供新思路。
賓大團隊的成果證明,通過AI賦能的設計工具與化學-生物催化協同策略,人類能夠突破傳統合成路線的限制。這條高效、環保的 DHAA 合成路徑,不僅為青蒿素的大規模生產開辟了新可能,也為合成生物學領域提供了一條可復用的創新范式——當化學與酶法“握手”,AI 與人類“共謀”,未來藥物的制造將更加智能、綠色與普惠。
1.Upadhyay V, Li H, He J, et al. Combining Chemical Catalysis with Enzymatic Steps for the Synthesis of the Artemisinin Precursor Dihydroartemisinic Acid[J]. ACS Synthetic Biology, 2025.
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