接上篇,我們介紹了如何在 GraphPad 中創建圖表。今天學霸菌主要講解它的數據統計分析功能及圖表的多種導出格式。
圖源:https://academic.oup.com/nar/article/49/8/4421/6225232?login=falsehttps://www.nature.com/articles/s41586-024-08532-4
一、數據統計分析功能
GraphPad Prism 提供了從基礎到高級的多種統計分析方法,以下是 GraphPad Prism 主要統計分析功能,大家可以根據數據類型和研究需求選擇合適的分析工具。
1
基礎統計分析:
正態性檢驗:通過 Shapiro-Wilk 檢驗或 Kolmogorov-Smirnov 檢驗判斷數據是否符合正態分布。
t 檢驗:包括獨立樣本 t 檢驗、配對樣本 t 檢驗和單樣本 t 檢驗,用于比較兩組數據的均值差異。
單因素方差分析(ANOVA):用于比較三組或以上數據的均值差異,支持多重比較校正(如 Tukey、Bonferroni 等方法)。
2
非線性回歸分析:
曲線擬合:支持多種非線性回歸模型(如指數增長、Logistic 曲線、Sigmoidal 曲線等),自動計算擬合參數和 R2 值。
劑量反應曲線:用于分析藥物劑量與生物效應之間的關系,支持 IC50/EC50 計算。
3
生存分析:
Kaplan-Meier 曲線:用于分析生存數據,支持 Log-rank 檢驗比較組間差異。
Cox 比例風險模型:用于多因素生存分析。
4
相關性分析:
Pearson 相關性:用于分析連續變量之間的線性關系。
Spearman 相關性:用于分析非正態分布數據或等級數據的相關性。
5
高級統計分析:
主成分分析(PCA):用于降維和數據可視化。
聚類分析:支持層次聚類和 K-means 聚類。
時間序列分析:用于分析時間相關的數據趨勢。
6
自動化分析:
一鍵分析:根據數據類型自動推薦合適的統計方法,簡化分析流程。
批量分析:支持同時對多組數據進行統計分析,提高效率。
在導入數據并創建出對應的圖表后
數據統計分析具體操作如下
選擇「Analyze」,根據研究需求選擇對應的分析方法進行分析。
Step 2:
選擇「Draw」選擇相應的標記方法。
Step 3:
選擇「文本標記圖標」進行統計結果的標記。根據發表需求可以標記為:p < 0.05 或 * 。
二、圖表導出格式
GraphPad Prism 提供了多種圖表導出格式,用戶可以根據需求選擇適合的格式,以便在論文、報告或演示中使用。選擇「Export」可以根據研究需求選擇不同的導出格式。以下是常見的導出格式及其特點:
1
圖像格式:
PNG:PNG 格式是一種無損壓縮圖像格式,支持透明背景,適合用于網頁展示和需要透明背景的場合。然而,PNG 格式的分辨率相對較小,可能不適合用于打印或出版高質量圖像。
JPEG:JPEG 格式是一種壓縮圖像格式,適合用于網頁展示和快速傳輸。然而,由于 JPEG 格式是有損壓縮,因此在需要高質量輸出的場合(如打印或出版)可能不太適合。
TIFF:TIFF 格式是一種位圖格式,適合用于高質量的圖像輸出。期刊通常要求 1,200 點/英寸(dpi)的 TIFF 文件,以確保圖像的清晰度。此外,TIFF 格式還支持選擇透明背景,方便與其他圖像或文本進行組合。
BMP:無損格式,文件體積較大,適合需要高質量圖像的場景。
2
矢量格式:
PDF:矢量格式,PDF 文件對矢量和字體進行編碼,因此生成的文件可以拉伸至任何尺寸而不會降低質量。PDF 格式是在 Mac 程序之間傳輸圖像的首選,同時也適合用于打印和出版。
EPS:矢量格式,是一種矢量圖像格式,與 PDF 類似,支持無限分辨率和透明背景。EPS 格式常用于出版和打印高質量圖像,適合用于專業排版軟件(如 Adobe Illustrator)。
SVG:矢量格式,適合用于網頁或交互式圖表。
選擇「Send」,可以將多個圖表內容導出為一個 PDF 文件;也可以導出為 PowerPoint 幻燈片。
PDF文件:將多個圖表合并為一個 PDF 文件,方便整體導出。
PowerPoint:將圖表直接導出為 PowerPoint 幻燈片,方便在演示中使用。
選擇「File」「Save」后,可以保存為 .pzfx 格式。
Prism 項目文件:保存為 .pzfx 格式,方便后續編輯和修改。
總結
如何在 GraphPad Prism 中,應用不同的高級統計模型。
題圖來源:圖蟲創意
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