公元1647年，明清易代的烽火從關外燒至嶺南，模式漸漸由陸戰變為水戰。其中，珠江中下游的對抗最為激烈，幾乎超過福建以外的其他各大水系。

雖然雙方乘坐的戰艦幾乎完全相同，卻在策略運用方面差異明顯，乃至收獲截然相反的交戰效果。

1647年1月 清軍幾乎不費吹灰之力就占領廣州

早在年初，數萬清軍由潮汕地區奔向廣州，僅靠偽造的官方文書就實現無血開城。不僅擒殺紹武帝朱聿鐭等宗室成員，還將尚未準備就緒的大批武器輜重都歸入囊中，順便降服來不及跑路的明朝官軍為自己所用。隨即，用繳獲、征集來的120艘船組成艦隊，輕而易舉的渡過瓊州海峽。彼時，珠江口各據點尚未完全臣服，仍不妨礙海南島就此被徹底征服。

許多在建明軍船只

成為清軍征服嶺南的重要載具

此后，這些歸化艦船繼續發光發熱，成為清軍縱橫嶺南地區的物流保障。尤其是在首府廣州到廣西梧州之間，皆可通過西江流域實現自由通航。以至于來回機動速度極快，還讓不少出生自北方的士兵逐步培養出水戰感覺。隨著該弱項被填補，堅持抵抗的明軍幾乎難以再尋覓到任何優勢。

淪為海盜的明軍殘部

始終在珠江下游堅持

同時，原效忠紹武帝的殘存勢力依舊在珠江口或沿海外島徘徊。這些海盜分別由首領馬元生、石璧、徐貴相和林芳節制，總數保持在40000人左右。他們經常返回內河，靠擄獲兩岸的財物堅持抗清,對本地造成的災害甚至超過征服者。由于清廷頒布的剃發易服令，不少城鎮居民被迫順從。豈料竟成海盜的殺人越貨借口，只能準備兩種服飾來回替換，生活自然苦不堪言。不久便對高舉明朝旗幟的隊伍心生惡感，屁股挪到清朝那邊。

由于清軍偷襲

半數南明海盜折損于正式開戰前

起初,坐鎮廣州的總督佟養甲想靠大赦令來息事寧人。在被下游的海盜們拒絕后，不斷加碼招降條件，召喚對方首領前來談判。經過幾番偓佺，有兩支船隊愿意嘗試，卻在登岸后遭到無情偷襲。由于還有些細枝末節沒有談攏，清軍索性將他們暴力抓捕，很快便公開處以極刑。接著縱火焚燒岸邊船隊，燒死大批來不及撤退的海盜成員。作為報復，后者頻頻襲擊岸上村鎮，燒毀數百棟房屋。直至用艦船塞滿航道，幾乎完全封鎖住對廣州的糧食輸送。因大多使用本地風格的廣船、東莞船，可以在逆風環境下劃槳驅動，所以持續性遠比普通盜匪要強出不少。

出于報復 南明海盜頻繁襲擊珠江兩岸

事已至此，負責兩廣軍務的李成棟只能親自出馬，率領一支有50艘戰船的艦隊出海。雖然同樣采用本地槳帆船，卻是由鄭芝龍資助建造的專業戰艦。故而能使用更好木料，擁有更堅固結構與更大噸位，在裝配16門輕型火炮的同時運載更多士兵。誠然，李成棟麾下士兵多來自北方，可能連游泳技巧都沒掌握。但多年的尸山血海歷練，以及加盟新朝的士氣激勵，讓他們遠比對面陣營更有適應力和戰斗意志。

清軍戰艦普遍比南明的更好一些

當年2月，清軍艦隊在對手完全不知道的情況下突然出現。李成棟的座艦一馬當先,率身后部眾碾壓所遇見的任何敵船。由于數量太多，缺乏準備的海盜們反而行動不便,被火炮、火繩槍與復合弓輪番射殺。因為不能如愿出海,也就無法靠規模優勢展開包圍，在混亂中顯得手足無措。更要命的是，清軍提前派船只把守出海口，又借助水流放火焚燒。因此，南明海盜們大量跳水求生，任由艦船、輜重落入敵手。除100艘狀態最好的船只外,余下的都被獲勝者燒掉。

雙方的第一次交鋒

以清軍完勝告終

稍后，清軍又接連攻陷忠于南明的順德、東莞兩城，強迫澳門的葡萄牙人向自己效忠。奈何約20000人的主力前腳開拔，珠江下游的海盜便迅速死灰復燃。這次，他們重新在海外島嶼集結起萬余人，三番兩次回到廣州等主城鎮。甚至在7月與投誠官軍建立聯系，險些靠內外呼應殺回首府。最后雖功虧一簣，還是放火將港內的絕大部分艦船燒毀。只有幾艘受炮臺保護的船只得以幸免，也徹底暴露出自身缺乏合格攻堅能力的弱點。

南明海盜的反擊

同樣讓廣州港損失慘重

于是，本已進軍廣西的李成棟被再次召回廣東，重新登船扮演巡防艦隊。他剛獲悉對手聚集在澳門前藍塘和香山城之間，便下令一周內三次前去追索。南明方面并不急于迎戰，只滿足于采取游而不擊套路，嘗試將清軍吸引到海上加以圍殲。另一方面又加緊招募新援，從潮汕、漳泉和粵西三地搜羅同僚入伙。奈何對方始終滿足于掃蕩珠江航道，從不冒進至外洋水域。佟養甲則繼續留守廣州，在一場短暫陸戰中挫敗反清武裝偷襲，順便把更多富有劃槳經驗的本地人送往水師報道。

不斷擴編的海盜船隊

在指揮協調方面有嚴重缺陷

到7月下旬，積怨已久的雙方終于爆發決戰。彼時，海盜的艦船數量恢復至260艘，不再懼怕正面較量。只因為各分隊來源復雜，所用船只風格多樣，不免在紛亂繁雜的沙場上出現混亂。僅僅憑借數量優勢，才得以在沖突剛爆發時稍稍占優。相比之下，李成棟的旱鴨子部隊更看重陣式排列。哪怕幾艘船遭遇數倍敵軍的前后夾攻，始終不給對面任何可乘之機。這種高水平防御背后，則是南明方面的致命缺陷。由于害怕損失，他們總要與敵艦保持些許距離，只用弓弩、標槍和劣質火器實施殺傷。一旦清軍集中火力回應，再迫近發動跳幫攻擊，就立刻支撐不下去。

由于害怕損失

南明船只總是希望與對手保持距離

此外，南明船隊僅僅是臨時組合,由不同將官指揮不同分隊。故而缺乏應有的協調行動;不免產生相互猜疑。若有支隊指揮官缺乏勇氣,其他船只必定會跟著逃跑，接著蔓延到其他支隊頭上。剩下少數群體頑強作戰,卻因為戰術缺陷而毫無章法。無論多么英勇,都不得不向奮勇前進的清軍屈服。最后的垂死掙扎，也不過是將類似劇情反復上演幾遍。除較早逃出珠江口外，其余船只都難逃被焚毀或占領的厄運。

清軍往往利用艦船和紀律獲得優勢

到了8月，屢次復蘇的海盜勢力趨于消停。哪怕不少幸存者轉進粵西或福建，已不再有能力大規模威脅廣州。

諷刺的是，堪稱頭號功臣的李成棟，始終在封賞方面始終不能比肩佟養甲。這既是因為自己入伙較晚，也是由于對方的漢八旗身份。從此埋下貪婪的種子，在來年倒戈回南明陣營......