口服藥物在穿越胃酸、消化酶及腸道菌群的“三重屏障”時,往往遭遇降解。根據公開消息,超過 90% 的生物大分子在抵達小腸前已失活,這迫使絕大多數生物藥仍依賴注射給藥,嚴重限制了臨床應用。
近年來,科學家嘗試將工程菌改造為“活體藥物工廠”,直接在腸道內合成藥物。然而,工程菌與土著菌群的定殖競爭、長期存活難題始終未解。
近日,美國弗吉尼亞理工大學Bryan B. Hsu 團隊與李立武團隊另辟蹊徑,提出一項顛覆性策略,他們設計了一種噬菌體病毒,在感染腸道細菌的同時釋放蛋白質類藥物。相關成果以“Sustained in situ protein production and release in the mammalian gut by an engineered bacteriophage”為題發表于 Nature Biotechnology。
噬菌體是自然界中數量最多的生物實體,其生命周期具有高度定向性:感染宿主菌后,噬菌體 DNA 會劫持細菌的轉錄機器,啟動自身基因的級聯表達,最終通過裂解宿主釋放子代噬菌體。研究團隊敏銳捕捉到這一特性——若將治療性蛋白基因嵌入噬菌體基因組,是否能在裂解過程中同步釋放治療分子?
為驗證這一假設,團隊選取 T4 噬菌體(靶向非致病性大腸桿菌)作為模型。首先,他們構建了攜帶超折疊綠色熒光蛋白(sfGFP)的工程化 T4 噬菌體(T4::sfGFP)。體外實驗顯示,感染后細菌裂解液中 sfGFP 熒光強度達 0.5–1.0 × 10? AU/OD,較未感染組(7 × 103 AU/OD)提升近千倍,證實噬菌體裂解可高效釋放胞內蛋白。進一步,團隊系統篩選了 T4 噬菌體的內源性啟動子,發現晚期啟動子 gp22 在維持噬菌體滴度或下降約 2 倍的同時,驅動 sfGFP 表達量最高。這種時空調控機制確保蛋白合成與噬菌體復制周期同步,為體內應用奠定了技術基礎。
在小鼠模型中,研究人員通過抗生素預處理清除部分腸道菌群,并引入工程化大腸桿菌定殖后,口服 T4::sfGFP 噬菌體以評估其體內表達情況。實驗結果表明,噬菌體在小鼠腸道內能夠穩定定殖,糞便中噬菌體滴度維持在 10?–10? PFU/g,并未引發菌群的顯著紊亂。熒光顯微鏡觀察發現,sfGFP 信號富集于腸道粘膜層,與粘蛋白標記物高度共定位,表明蛋白能夠靶向作用于腸道屏障表面。單次給藥后,sfGFP 信號可持續存在 4 天以上,突破了傳統工程菌依賴長期定殖的技術瓶頸,證明噬菌體可通過周期性感染和裂解循環,在腸道局部形成“脈沖式”藥物釋放模式,為后續疾病治療研究提供了有力支持。
在疾病治療實驗中,研究團隊構建了 T4::serpin 和 T4::clpB 兩種工程化噬菌體,并在炎癥性腸?。↖BD)和肥胖小鼠模型中測試其治療效果。
針對 IBD,研究人員利用 T4::serpin 噬菌體在宿主菌中表達絲氨酸蛋白酶抑制劑 Serpin B1a,以抑制中性粒細胞彈性蛋白酶(NE)的活性。在葡聚糖硫酸鈉誘導的結腸炎模型中,T4::serpin 治療顯著降低了糞便 NE 活性(下降 85%),結腸組織損傷評分減少 40%,同時結腸中性粒細胞表面抗炎標志物 CD24 表達上調 2.3 倍,提示炎癥微環境向修復表型轉化。
針對肥胖和代謝綜合征,T4::clpB 噬菌體在腸道內表達 ClpB 蛋白,該蛋白因與促黑素細胞激素 α-MSH 的結構同源性,能夠激活腸道內分泌細胞的 MC4R 受體,進而抑制食欲。在高脂飲食誘導的肥胖小鼠模型中,T4::clpB 治療使體重增幅減少 30%,食物攝入量下降 22%,血清促炎因子 IL-1β 和 IL-23 水平分別降低 64% 和 57%,并顯著改善了腸道屏障功能。這些實驗結果表明,工程化噬菌體不僅能夠在腸道內持續產生治療蛋白,還能在多個疾病模型中展現明顯的生理效應,證明其在精準醫療中的應用潛力。
相較于傳統口服生物藥,噬菌體遞送系統具有獨特優勢。它能夠直接在腸道局部釋放蛋白,避免系統性分布導致的脫靶效應。噬菌體與宿主菌形成動態平衡,可按需釋放蛋白,減少頻繁給藥需求。T4 噬菌體僅感染特定大腸桿菌,且無法侵染真核細胞,在初步毒理評估中未發現組織病理學異常。
然而,臨床轉化仍面臨挑戰,包括如何適應個體化菌群差異、優化蛋白表達效率以及長期使用對腸道生態的影響等。未來,結合合成生物學工具,噬菌體工程有望進一步拓展其應用范圍,例如整合環境感應啟動子,實現病理微環境下的精準釋藥,或搭載 CRISPR 系統,實現基因編輯和治療蛋白遞送的同步調控。此外,噬菌體遞送策略不僅局限于腸道,還可拓展至呼吸道、皮膚等微生物生態系統,為哮喘、特應性皮炎等疾病提供新的治療思路。
這一研究不僅為口服生物藥開發提供了全新范式,也標志著噬菌體從“抗菌武器”向“治療載體”的功能躍遷。隨著技術的不斷發展,工程化噬菌體有望成為精準醫療的重要工具,為炎癥性腸病、糖尿病,甚至神經退行性疾病的治療提供微生物驅動的創新路徑。
1.Baker, Z.R. et al. Sustained in situ protein production and release in the mammalian gut by an engineered bacteriophage. Nat Biotechnol (2025). https://doi.org/10.1038/s41587-025-02570-7
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