▎藥明康德內(nèi)容團(tuán)隊(duì)編輯
還記得那對(duì)“半路出家”投身朊病毒病研究的學(xué)霸夫妻嗎? 妻子被確診患有致命的遺傳性朊病毒病后,夫妻二人毅然改行投身科學(xué)研究,期望能找到破局之法,他們的研究成果去年榮登著名學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》。僅僅半年后,他們又與堿基編輯領(lǐng)域的先驅(qū)劉如謙(David Liu)教授攜手合作,共同開(kāi)發(fā)出一種針對(duì)朊病毒病的基因編輯治療策略。在動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)中,該療法成功將朊病毒病小鼠的壽命延長(zhǎng)了50%,展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力,有望成為一種一勞永逸、根治朊病毒病的一次性療法。在本文中,藥明康德內(nèi)容團(tuán)隊(duì)將帶領(lǐng)讀者一同回顧這對(duì)夫妻的科研歷程,并深入了解他們的最新科學(xué)進(jìn)展。
▲Eric Minikel(左)和Sonia Vallabh(右)(圖片來(lái)源:博德研究所)
命運(yùn)的拐點(diǎn)
2009年,正在哈佛法學(xué)院攻讀法律職業(yè)文憑的Sonia Vallabh迎來(lái)了人生的幸福時(shí)刻,她與正在麻省理工學(xué)院攻讀城市規(guī)劃與交通碩士的Eric Minikel走入了婚姻殿堂。但僅僅一年之后,一場(chǎng)重大變故徹底改變了這對(duì)新人的人生軌跡。
2010年,Vallabh的母親開(kāi)始出現(xiàn)視力模糊的癥狀,但病情迅速惡化,各種癥狀接踵而至,她的身體狀況急轉(zhuǎn)直下,很快便失去了行走能力,無(wú)法與人正常交流,甚至無(wú)法進(jìn)食……在出現(xiàn)癥狀后的短短10個(gè)月,Vallabh的母親便在恐懼中離世。在這段艱難的時(shí)光里,始終無(wú)人知曉真正的病因,直到尸檢報(bào)告無(wú)情地揭露了真相。
Vallabh的母親死于致死性家族性失眠癥(fatal familial insomnia,F(xiàn)FI),這是一種遺傳性朊病毒病。在我們的大腦中,存在一類(lèi)名為朊病毒蛋白(prion protein,PrP)的細(xì)胞表面蛋白。在正常情況下,PrP并不會(huì)對(duì)健康造成不良影響。然而,一旦PrP發(fā)生構(gòu)象改變,便會(huì)引發(fā)一系列連鎖反應(yīng)。錯(cuò)誤折疊的PrP會(huì)形成有毒的聚集體,并在大腦內(nèi)不斷擴(kuò)散傳播,最終導(dǎo)致神經(jīng)元死亡,這類(lèi)疾病便是致命且無(wú)法治愈的朊病毒病。
圖片來(lái)源:123RF
我們最為熟知的朊病毒病便是具有傳染性的瘋牛病,除此之外,還有一些朊病毒病是由基因突變引起的,Vallabh母親所患的致死性家族性失眠癥便是由PRNP D178N突變所致。PRNP D178N突變屬于常染色體顯性遺傳,這意味著Vallabh有50%的概率繼承這一致命突變。
從零開(kāi)始,逆天改命
不幸的是,Vallabh發(fā)現(xiàn)自己正是那50%中的一員,她同樣攜帶了這一致病突變。面對(duì)似乎已注定的命運(yùn)——重蹈母親的覆轍,靜候癥狀的出現(xiàn)與惡化,直至生命的終結(jié),Vallabh與丈夫選擇了不屈抗?fàn)帯K麄円闳粵Q定從零開(kāi)始,踏入生物學(xué)領(lǐng)域,尋求自救之道。
2014年,憑借不懈的努力與堅(jiān)定的決心,兩人同時(shí)申請(qǐng)到博德研究所(Broad Institute)攻讀博士學(xué)位。五年后,他們順利畢業(yè),并在博德研究所組建了自己的實(shí)驗(yàn)室。他們的實(shí)驗(yàn)室專(zhuān)注于一個(gè)核心目標(biāo):致力于在有生之年預(yù)防和治療朊病毒疾病。
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令人驚嘆的是,這對(duì)半路出家的科學(xué)家在研究領(lǐng)域迅速嶄露頭角,取得了顯著的進(jìn)展。
2019年,夫妻二人與合作者在PNAS期刊上發(fā)表了利用現(xiàn)有工具監(jiān)測(cè)腦脊液中PrP水平的新策略;一年后,他們又在Nucleic Acids Research雜志上提出通過(guò)反義寡核苷酸(ASO)介導(dǎo)的PrP抑制策略。該策略表明,即使僅抑制25%的PrP,也可以顯著延長(zhǎng)感染朊病毒小鼠的生存期并延遲疾病發(fā)作。值得一提的是,目前基于這一策略所開(kāi)發(fā)的ASO候選藥物ION717已進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。
與此同時(shí),Vallabh和Minikel并未停下探索的腳步。他們與Whitehead生物醫(yī)學(xué)研究所(Whitehead Institute for Biomedical Research)的Jonathan Weissman教授合作開(kāi)發(fā)了一款名為CHARM的表觀遺傳編輯工具,能夠沉默整個(gè)大腦中編碼PrP的基因,為致命性朊病毒病以及其他由有害蛋白聚集引起的神經(jīng)退行性疾病患者提供了潛在的治療策略。這一研究成果登上《科學(xué)》雜志。
與時(shí)間賽跑,不斷突破
在短時(shí)間內(nèi)取得了如此顯著的成就后,這對(duì)夫妻并未滿(mǎn)足于現(xiàn)狀,而是繼續(xù)與時(shí)間賽跑。近日,他們與劉如謙教授團(tuán)隊(duì)合作,在《自然-醫(yī)學(xué)》上發(fā)表了最新研究成果。
在這項(xiàng)研究中,合作團(tuán)隊(duì)共同開(kāi)發(fā)出了一種創(chuàng)新的基因編輯療法,用于治療朊病毒病。在表達(dá)人類(lèi)PRNP基因的轉(zhuǎn)基因朊病毒小鼠模型中,研究人員采用堿基編輯技術(shù)永久性地修改了PRNP基因位點(diǎn),從而顯著降低了小鼠大腦中PrP的表達(dá)水平。這一方法不僅使大腦中致病的朊病毒蛋白水平降低達(dá)60%,而且成功地將小鼠的壽命延長(zhǎng)了約50%,首次證實(shí)降低朊病毒蛋白水平可顯著延長(zhǎng)感染朊病毒蛋白動(dòng)物的壽命,為治療朊病毒病帶來(lái)了新的希望。
鑒于當(dāng)前朊病毒病尚無(wú)根治之法,該療法標(biāo)志著向預(yù)防疾病進(jìn)展或緩解已出現(xiàn)癥狀的朊病毒病患者病情的治療策略邁出的重要一步。尤為值得一提的是,堿基編輯療法在此展現(xiàn)出巨大的潛力,有望作為一種一次性治療方法,惠及所有朊病毒病患者,無(wú)論其致病基因突變類(lèi)型如何。事實(shí)上,早在這篇研究發(fā)布之前,Vallabh和Minikel就已經(jīng)開(kāi)始著手探索如何將基因編輯技術(shù)應(yīng)用于朊病毒病的預(yù)防和治療。
回溯至2013年CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)誕生之初,Vallabh與Minikel就開(kāi)始思索,是否能利用這一革命性技術(shù)來(lái)破壞編碼朊病毒蛋白的基因。2018年,同樣就職于博德研究所的劉如謙教授主動(dòng)向二人尋求合作,彼時(shí)他的實(shí)驗(yàn)室剛剛研發(fā)出堿基編輯技術(shù)。劉教授提議通過(guò)諸如在遺傳密碼中引入“終止”編碼信號(hào)等策略,有效停止致病蛋白質(zhì)的合成。為治療朊病毒病提供新的思路。
圖片來(lái)源:123RF
而另一個(gè)關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)最終促成了這項(xiàng)合作。Vallabh和Minikel在研究gnomAD等群體數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)發(fā)現(xiàn),PRNP基因中自然發(fā)生的突變R37X能降低PrP蛋白的表達(dá)水平,并且不會(huì)對(duì)人體產(chǎn)生有害的副作用。這一發(fā)現(xiàn)給他們帶來(lái)了希望,即利用堿基編輯技術(shù)引入相同的突變基因,可能會(huì)對(duì)朊病毒病起到保護(hù)作用。
在事后的回憶中,Minikel表示:“我們意識(shí)到,這是利用人類(lèi)遺傳學(xué)為堿基編輯技術(shù)提供關(guān)鍵信息的絕佳契機(jī)。”
雙AAV載體助力腦部精準(zhǔn)藥物遞送
在這項(xiàng)研究中,研究團(tuán)隊(duì)成功證明了堿基編輯器能夠在人體細(xì)胞中高效地植入PRNP R37X突變,并且?guī)缀醪粫?huì)產(chǎn)生不必要的副產(chǎn)物。然而,為了實(shí)現(xiàn)治療效果,研究人員需要將堿基編輯器精準(zhǔn)地遞送至大腦。
為此,研究小組開(kāi)發(fā)了一對(duì)腺相關(guān)病毒(AAV)載體。這些AAV載體能夠通過(guò)直接注入中樞神經(jīng)系統(tǒng),或通過(guò)外周注射高效穿越血腦屏障來(lái)轉(zhuǎn)導(dǎo)神經(jīng)元細(xì)胞,從而將堿基編輯器包裝并遞送至腦細(xì)胞中。每個(gè)AAV載體均包含一個(gè)U6啟動(dòng)子,用于表達(dá)編碼PRNP R37X的單向?qū)NA(sgRNA)。此外,每個(gè)載體還分別包含融合了蛋白質(zhì)內(nèi)含肽(intein)的堿基編輯器的一半。當(dāng)兩種載體共同轉(zhuǎn)導(dǎo)時(shí),功能性堿基編輯器得以重建。
隨后,研究人員將AAV注射入感染了人類(lèi)朊病毒蛋白的小鼠體內(nèi)。結(jié)果 顯示,在預(yù)期進(jìn)行編輯的基因拷貝中,該編輯系統(tǒng)成功植入了R37X突變,平均編輯成功率達(dá)到37%。與未處理的小鼠相比,朊病毒蛋白水平降低了50%,小鼠的壽命也延長(zhǎng)了約50%。
為了進(jìn)一步優(yōu)化該編輯系統(tǒng),科學(xué)家們對(duì)其進(jìn)行了多方面的改進(jìn),旨在提高編輯效率并限制向非靶向組織的遞送。通過(guò)改進(jìn)后的系統(tǒng),研究人員在AAV劑量降低6倍的情況下,觀察到朊病毒蛋白水平降低了63%。
未來(lái),研究團(tuán)隊(duì)計(jì)劃將堿基編輯載荷的體積縮小,因?yàn)殡pAAV的生產(chǎn)成本相對(duì)較高。此外,他們還打算開(kāi)發(fā)一種策略,利用先導(dǎo)編輯技術(shù)(該技術(shù)能夠進(jìn)行比單個(gè)堿基變化更復(fù)雜的DNA編輯)來(lái)植入一種保護(hù)性突變。這種突變不會(huì)完全關(guān)閉蛋白質(zhì)的生產(chǎn)流程,而是確保朊病毒蛋白本身具有良性特性,從而為治療朊病毒病提供更安全有效的途徑。
盡管目前的研究成果令人鼓舞,但對(duì)于這對(duì)積極與命運(yùn)抗?fàn)幍姆蚱迊?lái)說(shuō),將這些科學(xué)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為成熟的臨床療法仍是一條漫長(zhǎng)而充滿(mǎn)挑戰(zhàn)的征途。正如Minikel在采訪(fǎng)中所言,“要將這一成果發(fā)展為臨床療法,我們還有很長(zhǎng)的路要走。但看到目前展現(xiàn)出的諸多可能性,確實(shí)令人感到非常興奮。”
時(shí)至今日,朊病毒病的死亡陰影依舊籠罩著他們,同時(shí)也威脅著全球眾多患者的生命,作為兼具患者與朊病毒病研究前沿科學(xué)家雙重身份的人物,恐怕沒(méi)有人比Vallabh更能深刻體會(huì)這些患者所面臨的困境和絕望。他們的抗?fàn)帲仁菫榱俗晕揖融H,也是為了無(wú)數(shù)同病相憐的患者爭(zhēng)取希望。我們期待這對(duì)勇敢的夫妻能夠在抗擊朊病毒的征程上取得更多勝利,祝愿他們?cè)缛者_(dá)成所愿——在有生之年讓朊病毒病成為一種可防可治的疾病。
參考資料:
[1] An, M., Davis, J.R., Levy, J.M. et al. In vivo base editing extends lifespan of a humanized mouse model of prion disease. Nat Med (2025). https://doi.org/10.1038/s41591-024-03466-w
[2] Gene editing extends lifespan in mouse model of prion disease,Retrieved Jan 17, 2025 from https://www.broadinstitute.org/news/gene-editing-extends-lifespan-mouse-model-prion-disease
[3] A CHARMed collaboration created a potent therapy candidate for fatal prion diseases. Retrieved Jan 17, 2025 from https://www.eurekalert.org/news-releases/1048956
[4] Vallabh, S. M. et al. Prion protein quantification in human cerebrospinal fluid as a tool for prion disease drug development. PNAS 201901947 (2019)
[5] Minikel, E. V. et al. Prion protein lowering is a disease-modifying therapy across prion disease stages, strains and endpoints. Nucleic Acids Res. (2020)
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