近日,重慶大學醫學院羅陽教授聯合山東大學第二醫院王傳新教授、張洪博士后在《Small Methods》發表題為“Commercial Strip-inspired One-pot CRISPR-based Chip for Multiplexed Detection of Respiratory Viruses”的文章,并獲選為2025年首期封面文章。該文章以商業妊娠試紙作為結果輸出載體,構建了RECOGNIZER(Re-building commercial pregnancy strips via large-size nanoflowers)檢測體系,可在25分鐘內同時檢測4種呼吸道病毒。該體系利用具有大比表面積的DNA納米花(DNFs)用于人體絨膜促性腺激素(hCG)報告探針的高效裝載,信噪比達到10倍以上。經等溫擴增預處理后,該方法檢出限低至10 拷貝/微升,且50例臨床咽拭子樣本驗證準確率達100%。RECOGNIZER體系具有高度的可編程性,有望成為用戶友好的病毒感染監測平臺,為病毒大流行的應急救援提供技術支持。
RECOGNIZER標準檢測流程包括樣本裂解、一步法信號擴增和微流控芯片讀取,僅需25分鐘即可實現四種不同呼吸道病毒的同步檢測。
圖1.RECOGNIZER檢測原理
利用滾環擴增技術合成的DNFs呈現花狀結構,平均粒徑約為1 μm,儲存200天后仍然保持穩定。
圖2 DNFs的合成與表征
利用化學耦連將hCG蛋白標記在核酸探針上,并與DNFs雜交成功制備hCG-DNFs。相較于其他捕獲技術(如hCG-RCA,hCG-beads等),hCG-DNFs顯著提升hCG捕獲效率,且具有更高的CRISPR切割效率,信噪比超10倍。進一步構建四通道微流控芯片,可最低檢測到0.1 nM的新冠核酸樣本。
圖3 hCG-DNFs的制備與性能驗證
進一步對影響鏈置換和CRISPR切割反應的關鍵因素(如DNFs雜交比例、序列設計、緩沖液濃度、反應時間等),以達到最佳檢測靈敏度。
圖4 RECOGNIZER條件優化
在優化的反應條件下,系統地驗證了RECOGNIZER的檢測性能。RECOGNIZER對核酸片段的最低檢出限達5.42 皮摩爾。利用等溫擴增對病毒顆粒進行預擴增,RECOGNIZER可最低檢測到10拷貝/微升的病毒顆粒,滿足大規模篩查需求。與此同時,RECOGNIZER具有較高的特異性、可重復性和穩定性。50例臨床樣本檢測結果準確率達100%。
圖5 RECOGNIZER檢測性能驗證
為拓展RECOGNIZER檢測場景,研制高通量呼吸道病毒檢測芯片及讀取應用軟件,僅需簡單的加樣、掃描步驟,即可實現4種不同呼吸道病毒(新型冠狀病毒、中東呼吸系統綜合征冠狀病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒)的同步檢測,最低檢出限分別達到5.42 皮摩爾、5.85皮摩爾、4.38 皮摩爾和6.34皮摩爾。
圖6 高通量呼吸道病毒聯合檢測芯片驗證
綜上所述,本研究以商業妊娠試紙為讀取載體,構建了快速、可編程、超敏的高通量呼吸道病毒檢測平臺,極大地簡化了商業試紙條開發流程。
來源 重大檢驗
編輯 老Q
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