12月26號，臺北地檢署正式起訴，要求柯文哲判刑28年半。

12月27號，臺北地院裁定柯文哲3000萬交保，地檢署第一次抗告成功。

12月29號，臺北“高等法院”宣布撤銷地院裁定，發(fā)回更裁。當天下午，臺北地院再次裁定柯文哲免押，只是交保金從3000萬提高到7000萬。

12月31號，地檢署表示不服，二度提出抗告，又成功了。

1月1號，“高院”再次撤銷地院的裁定，發(fā)回更裁。

1月2號，臺北地院再次召開羈押庭，經(jīng)過數(shù)小時的庭審后，于當天晚上11點宣布，裁定柯文哲等4人重新羈押禁見。

柯文哲在交保以后僅三天，又被戴上手銬，重新押往臺北看守所。柯文哲在29日交保后，他做了兩件事情：一是，到醫(yī)院去看望病重的老父親。二是，于元旦主持召開了民眾黨擴大中央委員會。

柯文哲在會上表示，“今天我們開這個臨時中央委員會，其實最重要是我個人要請辭黨主席。因為我不可以讓這個冗長的司法程序，模糊焦點干擾整個臺灣民眾黨的發(fā)展，不希望民眾黨受到拖累。”

中央委員會按照柯文哲提議，一致推舉黃國昌擔任代理黨主席。柯文哲表示，“我個人是推薦黃國昌代理黨主席，他個人的政治的經(jīng)驗能力，還有在‘立法院’的表現(xiàn)，我想大家有目共睹。”

1月19號，民眾黨將召開黨代會，改選第四屆中央委員會和中評會。預計在2月下旬正式補選黨主席。

在臺灣政壇上活躍了10年的柯文哲時代，將基本告一段落了。

柯文哲在短短三天獲釋的時間，趕緊處理掉中央的人事問題，說明他預感到形勢不樂觀，知道自己有可能重新被拘押（事實證明也是如此）。

這次臺北地院宣布羈押的時間是三個月（前兩次都是兩個月），而且期滿將開延押庭，最多可以開六次。每次兩個月，這樣總共七次，最長可以拘押一年三個月。看來賴清德不把柯文哲處以重刑，是不會罷休，拖時間也得要把他耗死，

從柯文哲交保被羈押，再交保再被羈押的情況，可以明顯的看出，在柯文哲案件的審理過程中，明顯有政府公權力的介入。臺灣有人在評論此案時，明確指出，臺灣檢調部門如果不把柯文哲羈押起來，不僅臺北地檢署無法向上交代，就連檢察總長也無法向當局交代。

盡管對柯文哲羈押了4個月，依然沒有獲得柯文哲貪污受賄的鐵證，但是檢調部門始終堅持認為，柯文哲等人有逃亡和串供的可能，予以羈押。

北檢在庭審柯文哲的時候宣稱，“柯文哲是一個有政治影響力的人”。就是暗示他，因為他是民眾黨主席。于是柯文哲決定辭掉黨主席，以為這樣就沒有政治影響力了，并且同意高額交保，同意帶上腳鐐，結果北檢還是把他拘留了。有的評論認為，柯文哲是中了計了。

柯文哲在2號庭審的時候，有點發(fā)火，他對檢察官發(fā)問，我每次出門都有3-4個“記者”站在門口等候，哪里有逃亡的可能？

黃國昌等民眾黨人士也公開指責，“你腦袋有洞嗎，柯文哲要怎么逃，柯文哲要逃離這些‘攝影記者’都很困難的。”

“柯文哲在里面講，他說我死在里面我都不會逃亡，他說我如果逃亡了民眾黨怎么辦？他是第三大黨的黨主席，369萬票選出來的。”

“說他雖然辭了臺灣民眾黨的黨主席，他還是有實質的影響力，結果今天阿北在法庭里面，講的最霸氣的一句話，‘如果按照你的邏輯可以成立，你覺得我辭了臺灣民眾黨黨主席，還不夠，還有實質影響力，那你把我關到臺北看守所，我就沒有實質影響力了嗎？’”

最后柯文哲在法庭上怒斥法官，你們如果要繼續(xù)關押我，就直接說。難道把我關了，外面的支持我的“小草”就瞬間沒有聲音了嗎？

柯文哲被二度拘押后，民眾黨方面強烈表示，“你只要不順我的意，不押，我就一直抗告一直抗告一直抗告。給你搞了4個月了，如果證據(jù)還不夠，只顯現(xiàn)出你們的無能。”“用這種伎倆在霸凌柯文哲，自甘墮落為鷹犬，”“完全是政治辦案玩弄司法，臺灣在賴清德主政下，司法部門已經(jīng)淪為政治打手了。”

民眾黨代主席黃國昌更是動員全臺柯粉，“請各位朋友，1月11號下午2點鐘，自由廣場見。是臺灣的人民，站出來，對民進黨、對賴清德發(fā)出怒吼，集結的一天，我們要求賴清德，要求民進黨，還我司法正義。”

那么為什么賴清德當局非要把柯文哲整掉，其中一個很重要的原因，就是最近臺灣“立法院”，對賴清德的行政權力構成了重大制約，幾乎他想做什么事情都做不了。

在賴清德看來，把柯文哲整掉，有可能會把民眾黨的8席“立委”進行分化。當然他們這個想法，實際上也證明了是不可能的。