眾所周知，軍改后，武警部隊主要就是由內衛部隊、機動部隊、海警部隊、軍事院校和研究機構組成，其中武警海警部隊指的就是正軍級的武警海警總隊，所以武警海警總隊也是武警部隊唯一的海上力量。需要強調的是，武警海警總隊與武警內衛總隊、武警機動總隊在任務防區上有著極大的不同，其負責的是海上區域而非陸上區劃，專司海上維權執法、打擊海上違法犯罪活動、維護海上秩序和海洋環境、海上安全保衛等職責。而這種獨特的任務使命、遼闊的海上轄區也導致武警海警總隊在編制體制上有許多自己的特色。

一是內設有三個副軍級的海警海區指揮部協助分管指揮：由于武警海警總隊需要管轄管控我國所有的海域，其任務區橫跨黃渤海、東海、南海三大海區，甚至還要參與太平洋深處的國際海洋巡邏執法工作。因此，面對如此遼闊的海上轄區、如此復雜的任務形勢，單靠武警海警總隊機關顯然是無法有效應對處置的，于是武警海警總隊便效仿海軍三大艦隊（也叫三大戰區海軍）的設置，設立了海警“北海、東海、南海”海區指揮部。

海警海區指揮部都是副軍級建制，設有司令員、政委作為軍政主官，均為副軍職、授少將銜；指揮部擁有完整的領導指揮機構，設有參謀部、政治工作部和保障部，各自下轄相應的海警屬地支隊、海警機動支隊和海警航空大隊，各自分管本海區的海上相關工作。

二是除了下轄旅級支隊外，還設有武警部隊僅有的六個正師級機動支隊：目前，武警海警總隊在沿海省、直轄市、自治區共設立了11個屬地海警支隊，級別都是旅級（也就是副師級）；同時這些海警屬地支隊在相應的沿海地市級行政區還設有副團級的海警大隊。除此之外，為了加強對中遠海域的管控，武警海警總隊還專門設立了6個正師級的機動支隊，這6個海警機動支隊也是武警部隊僅有的6個正師級支隊，支隊正副職都是大校軍銜，且列裝有大噸位海警船，其中有不少海警船上配有各種口徑的自動艦炮。

三是在縣一級行政屬地設有副營級的海警工作站：武警海警總隊自組建以來，逐步將力量進行配套下沉，并于2019年6月首次分區域在沿海各縣、縣級市、市轄區設置了副營級的海警工作站，從而實現海上執法力量全域分布，以提高海上執法效能。

四是從武警海警大隊、支隊、海區指揮部到海警總隊都加掛了相應的海警局牌子：為更好的推進海上維權執法工作，從武警海警大隊、支隊、海區指揮部到總隊都分別加掛相應的海警局牌子，例如沿海屬地海警支隊同時叫作“中國海警局某某海警局”（海警大隊類似）、海警機動支隊同時叫作“中國海警局直屬第1—6局”，而三個海警海區指揮部則是分別叫作“中國海警局東海分局、南海分局、北海分局”。

所以，我國目前的海警機構共有中國海警局、海警海區分局和海警直屬局、省級海警局、市級海警局、海警工作站這幾個類別，分別負責所管轄區域的有關海上維權執法工作。