傳統中西醫之爭，時至二十一世紀的今天依舊是社會乃至醫界學界的熱點話題，前有中國各大中醫院校被世界醫學院校名錄除名，后有近日《北京市中醫藥條例》關于詆毀、污蔑中醫違法的法律提案，都把中西醫之爭推到了風口浪尖。殊不知這場關于中西醫的爭論從民國時期就已經開始了，到今天已經整整爭論了一個世紀！

五四新文化運動之后，關于中國傳統的文化道德，被新文化運動中的激進派別全盤否定，這其中就包括了延續了數千年的“中醫”！早在1913年，民國（北洋）教育部頒布的《大學規程》中，中醫就沒有入選，最高教育課程居然沒有“國醫”，這下中醫藥界人士可炸了鍋了，紛紛奔走相告，不久旋及組成抗議團體，要求民國政府重新商定《大學規程》中剔除“國醫”事項，但遭到民國政府否決。

五四運動高潮之時，中西醫已然公開決裂，中醫稱自己為“國醫”對方乃是“西醫”，而西醫則稱自己是“新醫”對方是“舊醫”雙方勢同水火，徹底劃分界限。在西醫看來中醫就是依附巫術，“依神道而斂財之輩”。阻礙了中國科學的進步，阻礙了中國改革的步伐。而中醫則認為自己傳承千年是經過“實證”的而西醫不過是“洋人”“糊弄人的玩意兒”就這樣雙方互加攻伐，互不相讓。

民國18年，這場爭論達到了最高潮！彼時國民政府衛生部召開第一屆中央委員會，會議由西醫出身之衛生部次長劉瑞恒主持，與會者：中央執行委員褚民誼、中華民國醫藥學會上海分會會長余云岫、上海中央大學醫學院院長顏福慶、南京衛生局長胡定安等14人，均為西醫界代表，且多主張廢止中醫。會上余云岫、褚民誼首次提出了“廢止中醫”的提案，頓時在傳統中醫藥界掀起了軒然大波！民國傳統中醫藥界人士紛紛出走街頭舉行抗議此等立法，上海中醫界全體人士紛紛罷診，并在上?！渡陥蟆返菆舐暶骺棺h，同時國醫國手還與會進行了抗辯，最終因中醫藥界全體人士的抗爭反對提議最終沒有被通過。

雖然廢止中醫的法案沒有通過，但通過了一個較為溫和的漸進法案，法案中規定中醫藥館必須進行依法登記，領取營業執照，對從醫人員進行知識教育培訓，組建中醫藥協會等規定。此后民國政府一直沿用此等辦法管理中醫藥館，中西醫之爭才漸漸稍有緩息。