前言:之前的一篇寫了NK細(xì)胞結(jié)合器(NK Cell Engagers,NKCE)激活靶點(diǎn)的選擇。 靶點(diǎn)決定了NK細(xì)胞活化的強(qiáng)度、持久性及被激活的NK細(xì)胞亞群。(感興趣的讀者可以查看《》)
但NKCE在臨床的最終目標(biāo)是具有功能強(qiáng)效和生產(chǎn)使用方便,這兩個(gè)方面都受到NKCE藥物分子結(jié)構(gòu)的影響。
以下,我們討論在藥物設(shè)計(jì)的角度,影響NKCE功能和生產(chǎn)的幾個(gè)關(guān)鍵考量。
01
免疫突觸
NK和腫瘤細(xì)胞間形成免疫突觸(Immune synapse,IS)是NK清除腫瘤細(xì)胞的前提。 NKCE進(jìn)入體內(nèi)后,可以接NK和靶細(xì)胞,促進(jìn)IS的形成,隨后通過受體結(jié)合,觸發(fā)發(fā)NK細(xì)胞的激活,最終裂解腫瘤細(xì)胞。
突觸間隙具有一定的空間限制,大多數(shù)生理性IS的突觸距離約為10-30 nm。 超過此大小的分子從無法進(jìn)入突觸間隙,那就更談不上誘導(dǎo)IS的形成。
因此,NKCE的大小對(duì)于穩(wěn)定IS形成至關(guān)重要。例如,與CD19比,CD20在細(xì)胞表面突出程度較低,在構(gòu)建靶向CD19和CD20的NKCE時(shí)可能需不同設(shè)計(jì),即使兩種抗原均在相同B細(xì)胞上表達(dá)并均募集NK細(xì)胞。
單克隆抗體的直徑約為10nm,非常適合IS的大小。然而 ,在NKCE設(shè)計(jì)中會(huì)添加多個(gè)功能片段,從而實(shí)現(xiàn)多特異性或多價(jià),這不可避免地會(huì)增加藥物分子的大小,因此在設(shè)計(jì)中需要綜合考量分子大小的限制。
此外,在IS的形成的早期階段,NK受體的高效聚集對(duì)于IS形成和NK 活化至關(guān)重要。在設(shè)計(jì)上,增強(qiáng)抗體的化合價(jià)可以通過增加親和力來潛在地改善靶標(biāo)結(jié)合。
腫瘤細(xì)胞表面抗原的下調(diào)是免疫逃逸的機(jī)制,如MM細(xì)胞中BCMA的下調(diào)。脫落的BCMA成為可溶性抗原,甚至能與膜結(jié)合的BCMA競爭結(jié)合NKCE并降低其功效。
02
NKCE的分子設(shè)計(jì)
目前,NKCE的分子設(shè)計(jì)通常參考T細(xì)胞接合器(TCE),畢竟二者的底層邏輯一致,而且TCE在臨床的使用更加成熟。
據(jù)分子結(jié)構(gòu),NKCE大致可分片段化和IgG型兩大類。由于片段結(jié)構(gòu)沒有Fc,通常比IgG形式更小。
2.1片段分子設(shè)計(jì)
大多片段結(jié)構(gòu)基于IgG的重鏈(H)和輕鏈(L)可變(V)區(qū)設(shè)計(jì),并且通常不涉及抗體的恒定區(qū)。 不同V區(qū)之間通過Linker鏈接(通常是VH和VL)形成scFv,并構(gòu)建NKCE。
在片段分子設(shè)計(jì)中,如何保證片段NKCE分子正確的包裝和折疊尤為重要。 這中間,兩個(gè)V區(qū)間的Linker決定配對(duì)的成功與否。
少于10個(gè)氨基酸的Linker通常不允許V區(qū)旋轉(zhuǎn)和折疊,導(dǎo)致鏈間配對(duì)。 研究表明,scFv的Linker應(yīng)至少3.5nm,才能允許兩個(gè)V區(qū)正確組裝成scFv。
典型的Linker是柔性和親水的,可最大限度減少胞內(nèi)蛋白折疊過程中的結(jié)構(gòu)干擾。在實(shí)踐中,藥物設(shè)計(jì)有幾種Linker比較常用,如(G4S/G3S) n 、218s或HMA。
其中 (G4S)n最常用,因?yàn)樗哂懈呷犴g性、低免疫原性以及絲氨酸殘基可以增強(qiáng)溶解度 的特點(diǎn)。此外,218s的蛋白水解穩(wěn)定性更高,聚集減少,而HMA則表現(xiàn)出較低免疫原性。
除了Linker外,次級(jí)鍵(如,二硫鍵)對(duì)成功組裝片段型NKCE也至關(guān)重要。在三體形式中,重鏈和輕鏈之間的二硫鍵促進(jìn)了配對(duì)。此外,在結(jié)構(gòu)域間引入二硫鍵有助于工程化IgG的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。
2.2改造的IgG形式
改造的IgG形式NKCE保留了Fc區(qū),因此分在大小比片段形式要大。此類NKCE的典型工程方法包括改變IgG骨架的一個(gè)臂的特異性,或?qū)⒖乖R(shí)別部分(scFv 或 Fab)添加到基礎(chǔ)IgG的N端或C端。
根據(jù)修飾的位置,改造的IgG,可進(jìn)一步細(xì)分為不對(duì)稱和對(duì)稱類型。
不對(duì)稱 IgG形式的 N KCE 在蛋白質(zhì)折疊 中面對(duì) 更多挑戰(zhàn)。 主要是生產(chǎn)過程中的同源二聚化及輕重鏈錯(cuò)配。目前 ,已有多種技術(shù)來克服這些問題。
對(duì)稱的IgG形式可輕松規(guī)避不對(duì)稱IgG固有的鏈配對(duì)問題,從而可能降低生產(chǎn)成本。 然而,對(duì)稱IgG如果想實(shí)現(xiàn)多特異性時(shí),它們的大小要比不對(duì)稱形式大得多。
還有,抗原識(shí)別部分(Fab 或者scFv)的選擇也會(huì)顯著影響NKCEs的功能。盡管Fab在輕重鏈正確配對(duì)方面存在挑戰(zhàn),但它在功能上比scFv更有效。
2.3其他形式
納米抗體,也稱VHH,是NKCE構(gòu)建中非常好用的一個(gè)結(jié)構(gòu)模塊。 與scFv/Fab不同,納米抗體僅使用重鏈即可實(shí)現(xiàn)特異性抗原結(jié)合。 因此,納米抗體可 規(guī)避 配對(duì)和折疊 問 題 ,使其成為 NK CE 設(shè)計(jì) 的重要選擇。
最近出現(xiàn)了一種稱為Affibody的新型抗原識(shí)別分子其結(jié)構(gòu)是 大小約為7 kDa的三螺旋亞結(jié)構(gòu),這也是NKCE設(shè)計(jì)中的備選結(jié)構(gòu)選擇 。
03
影響NKCE功能的其他因素
除了分子機(jī)構(gòu)設(shè)計(jì)對(duì)NKCE功能有直接影響外,在NKCE開發(fā)中還應(yīng)考慮其他因素,如組織浸潤、持久性,這些因素可顯著影響NKCE的療效。
目前大多臨床前的NKCE都是片段化的結(jié)構(gòu),它們分子量較?。?0-100 kDa),因此具有出色的組織浸潤特性和極低的免疫原性。然而,由于腎臟清除和降解,這些小尺寸的NKCE通常缺乏體內(nèi)持久性,需要頻繁輸注以維持有效的藥物水平(復(fù)雜的給藥步驟設(shè)計(jì)也是醫(yī)生比較頭疼的),這將增加治療費(fèi)用和患者的依從性。
因此,需要既定策略延長這些小尺寸NKCE的半衰期。這些方法也是藥物設(shè)計(jì)中常用的辦法。如與血清蛋白結(jié)合或融合(半衰期2-4周),或?qū)⑺鼈兣cFc偶聯(lián)。 將小尺寸NKCE連接到化學(xué)聚乙二醇(PEG)上,也可以延長半衰期。將片段結(jié)構(gòu)的 NKCE進(jìn)行多聚化以增加其大小也是一種解決方案, 如,AFM13是二聚化兩個(gè)V結(jié)構(gòu)域來構(gòu)建的。
改造后的IgG形式NKCE通常具有更大分子量,常超150 kDa。雖然較大尺寸會(huì)給組織滲透帶來挑戰(zhàn),但Fc區(qū)可以顯著增強(qiáng)它們的半衰期。
此外,F(xiàn)c區(qū)域可以募集除了NK細(xì)胞外的免疫胞,誘發(fā)ADCC、補(bǔ)體依賴性細(xì)胞毒性(CDC)和抗體依賴性細(xì)胞吞噬作用(ADCP)等機(jī)制,從而增加對(duì)腫瘤細(xì)胞的殺傷。
改造IgG的多特異性常用具有不同抗原特異性的識(shí)別區(qū)添加到IgG蛋白C 端或N端。這不可避免地增加了其分子大小,使組織滲透更具挑戰(zhàn)性,并可能增強(qiáng)免疫原性。
因此,平衡多特異性、組織滲透性和低免疫原性對(duì)于開發(fā)改造IgG形式的 NKCE至關(guān)重要。
04
NKCE的生產(chǎn)制造
NKCE的生產(chǎn)系統(tǒng)選擇也是一個(gè)重要因素,它決定了NKCE的產(chǎn)量和下游工藝的復(fù)雜性和成本。
最常采用兩種宿主系統(tǒng):細(xì)菌系統(tǒng)和哺乳動(dòng)物系統(tǒng)。細(xì)菌系統(tǒng)通常用于產(chǎn)生片段化的NKCE,如linked-scFv 型 NKCE。改造的IgG主要在哺乳動(dòng)物細(xì)胞(如CHO細(xì)胞)中生產(chǎn),因?yàn)樾枰g后加工才能成功鏈配對(duì)。
細(xì)菌系統(tǒng)的特點(diǎn)是廉價(jià)、快速和大批量生產(chǎn),但生產(chǎn)的蛋白質(zhì)通常需要重新折疊。帶有NKCE基因的表達(dá)質(zhì)粒被轉(zhuǎn)化到大腸桿菌,當(dāng)細(xì)菌培養(yǎng)物達(dá)到高密度時(shí),誘導(dǎo)NKCE表達(dá),并通過包涵體產(chǎn)生NKCE蛋白。從細(xì)菌系統(tǒng)收集原始NKCE蛋白通常需要1-2 天,然后又需要2-3天進(jìn)行復(fù)性和純化。
在哺乳動(dòng)物細(xì)胞系統(tǒng)(如HEK 293T 或 CHO細(xì)胞)中表達(dá) NKCE 可以繞過復(fù)性,因?yàn)檫@些細(xì)胞可以通過上清分泌功正確折疊的NKCE。
然而,哺乳動(dòng)物細(xì)胞系統(tǒng)的產(chǎn)量通常低于細(xì)菌系統(tǒng)的產(chǎn)量。通常,哺乳動(dòng)物細(xì)胞與編碼輕鏈或重鏈的表達(dá)載體共轉(zhuǎn)染或轉(zhuǎn)導(dǎo)。培養(yǎng)約6天后,收集上清液純化NKCEs,然后分析鏈大小和配對(duì)。
本文參考文獻(xiàn)還有幾家在開發(fā) NKCE 的公司資料都已上傳星球~
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