SARS相關(guān)冠狀病毒（SARSr-CoV）在過去二十年內(nèi)引發(fā)了兩次全球性疫情。蝙蝠作為這些病毒及多種高致病性病毒的自然宿主，監(jiān)測其攜帶的SARSr-CoV和共循環(huán)微生物對預(yù)防未來疫情以及理解病毒致病性具有關(guān)鍵性意義。

近日，中國科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗、周鵬團(tuán)隊(duì)的最新研究揭示了蝙蝠微生物組的復(fù)雜微環(huán)境以及蝙蝠中SARSr-CoV與其他哺乳動物相關(guān)病毒的普遍共感染現(xiàn)象，為了解病毒的潛在致病性和跨物種傳播的可能性提供了新的見解。該研究題為“Individual virome analysis reveals the general co-infection ofmammal-associated viruses with SARS-related coronaviruses in bats”，已發(fā)表于《Virologica Sinica》雜志。

主要發(fā)現(xiàn)

共感染現(xiàn)象普遍：在76份樣本中有高達(dá)25%的樣本檢測出至少攜帶一種哺乳動物相關(guān)病毒，尤其是甲型冠狀病毒。

微生物組復(fù)雜性：研究揭示了蝙蝠體內(nèi)復(fù)雜的微生物環(huán)境，發(fā)現(xiàn)了與哺乳動物、昆蟲和植物相關(guān)的病毒，以及可能對人類健康構(gòu)成威脅的細(xì)菌和真菌。

新病毒譜系：研究團(tuán)隊(duì)從樣本中鑒定出25個新的病毒基因組，其中一些代表了新的進(jìn)化譜系。

研究內(nèi)容

研究人員對來自中國南方和中部地區(qū)的蝙蝠病毒進(jìn)行了長達(dá)16年的監(jiān)測，并從10個省份或行政區(qū)的9種蝙蝠中鑒定出238份SARSr-CoV陽性樣本，并選擇其中76份樣本進(jìn)行了宏基因組學(xué)分析，用于檢測共循環(huán)微生物，包括潛在致病微生物。

首先，研究人員總結(jié)了樣本攜帶概率超過66.67%的主要病毒分類群。這些病毒可以根據(jù)它們的來源分為三類：（1）與哺乳動物相關(guān)的病毒：除冠狀病毒外，最常見的病毒是蝙蝠皰疹病毒，在51個樣本（67.1%陽性）中檢測到，主要與人類皰疹病毒7型有關(guān)。（2）與蝙蝠飲食相關(guān)的病毒：蝙蝠體內(nèi)普遍存在多種與植物或昆蟲有關(guān)的病毒，這些病毒可能是從飲食中獲得的。（3）與蝙蝠微生物組相關(guān)的病毒：與腸桿菌、寄生蟲或真菌相關(guān)的病毒也很普遍。

隨后，研究人員專注于研究哺乳動物相關(guān)微生物，并發(fā)現(xiàn)在76份樣本中有高達(dá)25%（19/76）的樣本檢測出至少攜帶一種哺乳動物相關(guān)病毒，尤其是甲型冠狀病毒，共有17%（13/76）的樣本至少與一種甲型冠狀病毒共感染。此外，在一個樣本中，研究人員發(fā)現(xiàn)了與三種其他病毒的共感染，反映了蝙蝠病毒組的復(fù)雜微環(huán)境。除了病毒，研究人員還確定了可能對哺乳動物有致病性的細(xì)菌或真菌，包括與人類疾病相關(guān)的細(xì)菌（例如李斯特菌）和與人類呼吸道疾病相關(guān)的真菌（莢膜組織胞漿菌）。

哺乳動物相關(guān)微生物

最后，研究團(tuán)隊(duì)從樣本中鑒定出25個新的病毒基因組，分屬6個不同的病毒科：包括與哺乳動物相關(guān)的圓環(huán)病毒科Circoviridae、冠狀病毒科Coronaviridae、小RNA病毒科Picornaviridae和細(xì)小病毒科Parvoviridae；與昆蟲相關(guān)的病毒科Dicistroviridae；以及與植物相關(guān)的病毒科Solemoviridae。這些新發(fā)現(xiàn)的病毒基因組表現(xiàn)出獨(dú)特的基因組序列特征，表明了它們可能是新病毒譜系或變體。

25個新病毒序列的基因組結(jié)構(gòu)

結(jié)論

綜上所述，這項(xiàng)研究深入分析了76份SARSr-CoV陽性蝙蝠樣本，揭示了蝙蝠微生物群的復(fù)雜微環(huán)境，發(fā)現(xiàn)了與哺乳動物、昆蟲和植物相關(guān)的病毒以及可能對人類健康構(gòu)成威脅的細(xì)菌和真菌，并鑒定出25個新的病毒基因組。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了持續(xù)監(jiān)測蝙蝠微生物群的重要性，并有助于進(jìn)一步評估病毒的潛在致病性和跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)。

參考文獻(xiàn)：Si HR, Wu K, Su J, et al. Individual virome analysis reveals the general co-infection of mammal-associated viruses with SARS-related coronaviruses in bats. Virol Sin. Published online June 28, 2024. doi:10.1016/j.virs.2024.06.008

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